RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 RHOVQ96L33 236 aa11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 APOL4Q9BPW4 351 aa11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 KRT84Q9NSB2 600 aa11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 DEGS1O15121 323 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 MAGEA2P43356 314 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 RBP2P50120 134 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 MTCP1P56278 107 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CPOQ8IVL8 374 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CHST5Q9GZS9 411 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 BATF3Q9NR55 127 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.68□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 TNFRSF11BO00300 401 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ATP1B3P54709 279 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 AQP4P55087 323 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ACTBP60709 375 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ROM1Q03395 351 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 TNFRSF9Q07011 255 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 MED21Q13503 144 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 Q6ZSR3 168 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 RDH12Q96NR8 316 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 R4GMQ9 66 aa11.67□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF785A8K8V0 405 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF254O75437 659 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CCNB2O95067 398 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ZP3P21754 424 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 DEFA5Q01523 94 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CDK5R1Q15078 307 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 LIN54Q6MZP7 749 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 RDH10Q8IZV5 341 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.66□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 H3BN98 237 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 PRODHO43272 600 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 SYT7O43581 403 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 RPP14O95059 124 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 TRGV3P03979 118 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CCL1P22362 96 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 IL3RAP26951 378 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 LSAMPQ13449 338 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 APOFQ13790 326 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 GK3PQ14409 553 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 GUCA2BQ16661 112 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CHST4Q8NCG5 386 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ALYREF-204ENST00000512673 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 NBR2O15453 112 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 KDM4BO94953 1096 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 TRBV12-3P01733 135 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 SLC2A5P22732 501 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 ACTBL2Q562R1 376 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 LINC00311Q8N616 119 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 GAB2Q9UQC2 676 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 MSGN1A6NI15 193 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 MITFO75030 526 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 E2F6O75461 281 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 NDUFB8O95169 186 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 SERPINA3P01011 423 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 HMGA2P52926 109 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 CXCR4P61073 352 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 FAHD1Q6P587 224 aa11.63□□□□□ -0.55
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms