RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 GHRLQ9UBU3 117 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM23O14925 209 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 UBBP0CG47 229 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT3P21217 361 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G7Q13093 441 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAM1Q15629 374 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TREML4Q6UXN2 200 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8N2B8 174 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 OR56B4Q8NH76 319 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 CFHR4Q92496 578 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 RPEQ96AT9 228 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC17A2O00624 439 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ORC5O43913 435 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 BPNT1O95861 308 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HBZP02008 142 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM3P40198 252 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 REG1BP48304 166 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10A3P58181 314 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 GNMTQ14749 295 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 TM2D1Q9BX74 207 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD17B6O14756 317 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL6IP5O75915 188 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 AMY1AP04745 511 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 AMY2AP04746 511 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 GZMHP20718 246 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 MADCAM1Q13477 382 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SPARTQ8N0X7 666 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 DRAM1Q8N682 238 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 BRS3P32247 399 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HERPUD1Q15011 391 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB11BQ15907 218 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf183Q5T699 404 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HES5Q5TA89 166 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9H521 79 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM30A4D0T7 59 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OOSP1A8MZH6 123 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SOCS1O15524 211 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2F2O95006 317 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSBP15848 533 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB9P28065 219 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 MNDAP41218 407 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGDIBP52566 201 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF134P52741 427 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 LYG1Q8N1E2 194 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 GNG12Q9UBI6 72 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0B4J203 849 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 M0QZ24 198 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SPINT2O43291 252 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CA11O75493 328 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 GLAP06280 429 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 C22orf42Q6IC83 251 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SVOPQ8N4V2 548 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00311Q8N616 119 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms