RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CHST5Q9GZS9 411 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SCML1Q9UN30 329 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ORM1P02763 201 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF141Q15928 474 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR4A5Q8NH83 315 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 B9D2Q9BPU9 175 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 WDR54Q9H977 334 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 EURLQ9NYK6 297 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 A6NED7 52 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L10A6NI86 522 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 GGTLC3B5MD39 225 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SLC31A1O15431 190 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SYNGR2O43760 224 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SOX14O95416 240 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PSKH1P11801 424 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 EVI2BP34910 448 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 GALMQ96C23 342 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRKQ15262 1439 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 LTAP01374 205 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF708P17019 499 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PYCR3Q53H96 274 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SDHAF4Q5VUM1 108 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TCF23Q7RTU1 214 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TAMM41Q96BW9 452 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 RAD50Q92878 1312 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 FABP12A6NFH5 140 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PSCAO43653 123 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TPM3P06753 285 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TPM4P67936 248 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS2Q13268 280 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PYDC2Q56P42 97 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CENPWQ5EE01 88 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 STOML3Q8TAV4 291 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 RBP7Q96R05 134 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ARL6Q9H0F7 186 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 METTL9Q9H1A3 318 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 U3KQK5 164 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1DQ01668 2161 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PNN7 141 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D1AO60880 128 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV4-1P06312 121 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CTSEP14091 401 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CTLA4P16410 223 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 GADD45AP24522 165 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CD40LGP29965 261 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2G2P60604 165 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 BLIDQ8IZY5 108 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 GPR22Q99680 433 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CEP170Q5SW79 1584 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 DAPL1A0PJW8 107 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 B4DEV8 164 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 M0QYV0 167 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB1BP1O14713 200 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1G2O95670 118 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 FBP1P09467 338 aa3.89□□□□□ -1.79
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