RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486429.1

CLDN11-206, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 998 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 OR8H3Q8N146 312 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 GAPTQ8N292 157 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 OR56B4Q8NH76 319 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN11-206ENST00000486429 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 A0A1W2PPE3 182 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 UBE2QL1A1L167 161 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 C12orf77C9JDV5 145 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 HSD17B6O14756 317 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SLC22A1O15245 554 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SPINT2O43291 252 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 ARL6IP5O75915 188 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 FAM106CPP0CH98 169 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 VSIG8P0DPA2 414 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 HTR2CP28335 458 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 FBLN7Q53RD9 439 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 Q6ZS46 218 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 MGLLQ99685 303 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 M0QZK8 103 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 IL3RAP26951 378 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 LOXL3P58215 753 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 OR10K2Q6IF99 312 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 PRR18Q8N4B5 295 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 DRAM1Q8N682 238 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 KCNK15Q9H427 330 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 GNG12Q9UBI6 72 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CCRL2O00421 344 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 BPNT1O95861 308 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 HBZP02008 142 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CHATP28329 748 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 UNC119Q13432 240 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 HES1Q14469 280 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 Q3ZCU0 254 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 LINC00311Q8N616 119 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CD28P10747 220 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM11P17152 192 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 REG1BP48304 166 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 GABARAPL2P60520 117 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 OR1L1Q8NH94 360 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CYYR1Q96J86 154 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 TM2D1Q9BX74 207 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 NOTCH1P46531 2555 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SLC17A2O00624 439 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 LPLP06858 475 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 CD37P11049 281 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 FABP5Q01469 135 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 P2RY14Q15391 338 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 GFI1Q99684 422 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 NICN1Q9BSH3 213 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 Q9H521 79 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 SLC31A2O15432 143 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 IGKV1D-33P01593 117 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 IGKV1-33P01594 117 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN11-206ENST00000486429 AMY1AP04745 511 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms