RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 COL6A5A8TX70 2615 aa14.67□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 VGLL3A8MV65 326 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 C12orf77C9JDV5 145 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 TOR1AO14656 332 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 LOXL3P58215 753 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 ARL6IP1Q15041 203 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 OR5R1Q8NH85 324 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 RAB3CQ96E17 227 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 ETV7Q9Y603 341 aa14.66□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 J3QR06 171 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 SCGNO76038 276 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 HTD2P86397 168 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 IDNKQ5T6J7 187 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 CYYR1Q96J86 154 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 DUX5Q96PT3 197 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 SSX3Q99909 188 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 AK3Q9UIJ7 227 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 PSG11Q9UQ72 335 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.65□□□□□ -0.06
CNKSR1-208ENST00000484874 LEUTXA8MZ59 168 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LY6LH3BQJ8 138 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 IGHV4-59P01825 116 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 HBZP02008 142 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 TGFBR1P36897 503 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CEACAM3P40198 252 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 DYNLT3P51808 116 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 STEAP3Q658P3 488 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR141Q7Z602 305 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LINC00311Q8N616 119 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CHIAQ9BZP6 476 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 MMP28Q9H239 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SPATA2Q9UM82 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 BTBD17A6NE02 478 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SERPINE3A8MV23 424 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 OOSP1A8MZH6 123 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 GABARAPO95166 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 HMGN3Q15651 99 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SSX2Q16385 188 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CTF1Q16619 201 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 UTF1Q5T230 341 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 NDNFQ8TB73 568 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 PIFOQ8TCI5 191 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 GALMQ96C23 342 aa14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM89A2RUT3 159 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 MFNGO00587 321 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 HKR1P10072 659 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 VBP1P61758 197 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 NCS1P62166 190 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LTC4SQ16873 150 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR107Q5VW38 600 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 OR1L1Q8NH94 360 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 Q9N2K0 584 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.62□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A0A6YYH2 397 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM172BPA6NC97 362 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 A6NJ64 397 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CD3GP09693 182 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 GNB3P16520 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SERPINB10P48595 397 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 CDNFQ49AH0 187 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 MORN2Q502X0 79 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 Q6ZPA2 131 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.61□□□□□ -0.07
CNKSR1-208ENST00000484874 LEAP2Q969E1 77 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms