RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 PSG11Q9UQ72 335 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0A6YYH2 397 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2QL1A1L167 161 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 A6NJ64 397 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 C12orf77C9JDV5 145 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 HSPB6O14558 160 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 TOR1AO14656 332 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 ITGB1BP1O14713 200 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 SPINT2O43291 252 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 TSPAN9O75954 239 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 PAHP00439 452 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 OMGP23515 440 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 CEACAM3P40198 252 aa11.28□□□□□ -0.6
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HDLBP-240ENST00000484412 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 NEK7Q8TDX7 302 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 C17orf50Q8WW18 174 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 PECRQ9BY49 303 aa11.28□□□□□ -0.6
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HDLBP-240ENST00000484412 MMP28Q9H239 520 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 SPATA2Q9UM82 520 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 ETV7Q9Y603 341 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 COL6A5A8TX70 2615 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-240ENST00000484412 SERPINE3A8MV23 424 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV4-59P01825 116 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 COX7A1P24310 79 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RPS19P39019 145 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 HMGN3Q15651 99 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 MORN2Q502X0 79 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR4K15Q8NH41 348 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RFESDQ8TAC1 157 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ABCG5Q9H222 651 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 C16orf95Q9H693 158 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RAB18Q9NP72 206 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 JPT1Q9UK76 154 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.27□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.26□□□□□ -0.61
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HDLBP-240ENST00000484412 A0A1W2PRF3 423 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1W2PRM7 423 aa11.26□□□□□ -0.61
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HDLBP-240ENST00000484412 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SSTR5P35346 364 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RAB7AP51149 207 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 EFNB2P52799 333 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 EBI3Q14213 229 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SSX2Q16385 188 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.26□□□□□ -0.61
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HDLBP-240ENST00000484412 CCDC107Q8WV48 283 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GALMQ96C23 342 aa11.26□□□□□ -0.61
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HDLBP-240ENST00000484412 Q9N2K0 584 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ING3Q9NXR8 418 aa11.26□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
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HDLBP-240ENST00000484412 BRS3P32247 399 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 KIR2DS4P43632 304 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF134P52741 427 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 PITPNAQ00169 270 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 PLA2G7Q13093 441 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.25□□□□□ -0.61
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