RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00596Q86U02 117 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC107Q8WV48 283 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL11Q969Q4 196 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 B9D2Q9BPU9 175 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL9Q9H1A3 318 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFP57Q9NU63 452 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ING4Q9UNL4 249 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEB3O15480 346 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SC5DO75845 299 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GZMHP20718 246 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD1BP29016 333 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC6A1P30531 599 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 F2RL1P55085 397 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIPK1Q13546 671 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FHL3Q13643 280 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q3ZCU0 254 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q499Y3 187 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOB3BQ86TA1 216 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF695Q8IW36 515 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 COMMD1Q8N668 190 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4K15Q8NH41 348 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1L1Q8NH94 360 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GHSRQ92847 366 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUL1Q969V5 352 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RDH12Q96NR8 316 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR14A2Q96R54 314 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 S1PR3Q99500 378 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PPK0 400 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUDT19A8MXV4 375 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 AIPO00170 330 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL24O00175 119 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP4M1O00189 453 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHG4P01861 327 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 HBZP02008 142 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNTFRP26992 372 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMB8P28062 276 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP3R1P63098 170 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNMTQ14749 295 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GGHQ92820 318 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RITA1Q96K30 269 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q96M66 194 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCOCQ9UIL1 159 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF580Q9UK33 172 aa6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOSP00540 346 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGF1P05019 195 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELANEP08246 267 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSIG8P0DPA2 414 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF2F2P13984 249 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MGMTP16455 207 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35B1P78383 322 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LSAMPQ13449 338 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXE3Q13461 319 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR50Q13585 617 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 INSL4Q14641 139 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIR2DS1Q14954 304 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MORN2Q502X0 79 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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