RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454561.2

TRBV5-4-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV5-4, Length 544 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4-201ENST00000454561 GFI1Q99684 422 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TM2D1Q9BX74 207 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 MMP28Q9H239 520 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TCF19Q9Y242 345 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 V9GY05 133 aa6.01□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C12orf77C9JDV5 145 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CHST1O43916 411 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 PSMB9P28065 219 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CHATP28329 748 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 LOXL3P58215 753 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 UNC119Q13432 240 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 MADCAM1Q13477 382 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 P2RY14Q15391 338 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C2orf76Q3KRA6 126 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C11orf88Q6PI97 169 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF773Q6PK81 442 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF554Q86TJ5 538 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM219Q86XT9 240 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM89BQ8N5H3 189 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C8orf31Q8N9H6 132 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR51D1Q8NGF3 324 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR10X1Q8NGY0 326 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 UBALD1Q8TB05 177 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CAPSLQ8WWF8 208 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 WFDC12Q8WWY7 111 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RPEQ96AT9 228 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM3DQ96BQ1 224 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAAP24Q9BTP7 215 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRSS22Q9GZN4 317 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF696Q9H7X3 374 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TAF9BQ9HBM6 251 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 GFOD1Q9NXC2 390 aa6□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 A0A1W2PPE3 182 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TIMM23O14925 209 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 SOCS1O15524 211 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 HBZP02008 142 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM106CPP0CH98 169 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RAB3BP20337 219 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 MYL9P24844 172 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CD24P25063 80 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 GNG10P50151 68 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RAB7AP51149 207 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 EFNB2P52799 333 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CLDN12P56749 244 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 KRTAP10-3P60369 221 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 Q3ZCU0 254 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 HES5Q5TA89 166 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 STEAP3Q658P3 488 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C22orf42Q6IC83 251 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 LINC00311Q8N616 119 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR1L1Q8NH94 360 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TOMM40LQ969M1 308 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CITED1Q99966 193 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 NICN1Q9BSH3 213 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 KCNK15Q9H427 330 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 GNG12Q9UBI6 72 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 RAB22AQ9UL26 194 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 SSR3Q9UNL2 185 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.99□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 A0A0A6YYD4 124 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 IFITM5A6NNB3 132 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 M0QZK8 103 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 PEX14O75381 377 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR2F2O95006 317 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 NAPSAO96009 420 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 IL3RAP26951 378 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 VEGFCP49767 419 aa5.98□□□□□ -1.45
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM50BP56557 158 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms