RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 CKLFQ9UBR5 152 aa15.96■□□□□ 0.15
ELL3-202ENST00000433927 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OGG1O15527 345 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TXNL1O43396 289 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ETV1P50549 477 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 FOXE3Q13461 319 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TMEM104Q8NE00 496 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 UBALD1Q8TB05 177 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SMIM19Q96E16 107 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 DUX3Q96PT4 197 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 S1PR3Q99500 378 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.95■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SPINT2O43291 252 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ELANEP08246 267 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MYL12AP19105 171 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 KIR2DS1Q14954 304 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TFAP2CQ92754 450 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 S100A14Q9HCY8 104 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 GNG12Q9UBI6 72 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.94■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 A0A1W2PP11 408 aa15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 C6orf183Q5T699 404 aa15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 RNF152Q8N8N0 203 aa15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 GHSRQ92847 366 aa15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 C12orf77C9JDV5 145 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 GPX5O75715 221 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 VDAC1P21796 283 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SOX6P35712 828 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ZNF137PP52743 207 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MED21Q13503 144 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 Q499Y3 187 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ORAI1Q96D31 301 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 RDH12Q96NR8 316 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ETAA1Q9NY74 926 aa15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OR5H8P0DN80 308 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 DEFB136Q30KP8 78 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 PRR18Q8N4B5 295 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 SLC31A2O15432 143 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 CA11O75493 328 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 IGHG4P01861 327 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 STEAP3Q658P3 488 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 RAB12Q6IQ22 244 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 OR4K15Q8NH41 348 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MUL1Q969V5 352 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 TENM3Q9P273 2699 aa15.9■□□□□ 0.14
ELL3-202ENST00000433927 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 HBZP02008 142 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 IGF1P05019 195 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 VSIG8P0DPA2 414 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 FSTP19883 344 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 ZNF134P52741 427 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 F2RL1P55085 397 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 CFHR3Q02985 330 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 CDH26Q8IXH8 852 aa15.89■□□□□ 0.13
ELL3-202ENST00000433927 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms