RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 JKAMPQ9P055 326 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ARID2Q68CP9 1835 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PRSS37A4D1T9 235 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FITM1A5D6W6 292 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR5B21A6NL26 309 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SIRPB1O00241 398 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SSSCA1O60232 199 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAL4O96015 105 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HLA-DRB1P01911 266 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FOLR2P14207 255 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CKS1BP61024 79 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0040Q15053 153 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF141Q15928 474 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 C3AR1Q16581 482 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HFEQ30201 348 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 COX7A2P2O60397 106 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAP1O75689 374 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GPX5O75715 221 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ERGP11308 486 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CAMPP49913 170 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXL2P58012 376 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DOK3Q7L591 496 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2C3Q8N628 320 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR1P1Q8NH06 330 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB1CQ92928 201 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SPSB2Q99619 263 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SARGQ9BW04 601 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 AUP1Q9Y679 476 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NBASA2RRP1 2371 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CACNA1CQ13936 2221 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 IFITM5A6NNB3 132 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 P2RY10O00398 339 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SOD3P08294 240 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SCAND1P57086 179 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PSG6Q00889 435 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF415Q09FC8 603 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 EDDM3AQ14507 147 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DOLPP1Q86YN1 238 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 C9orf40Q8IXQ3 194 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HIST1H4GQ99525 98 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CHST6Q9GZX3 395 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PARP11Q9NR21 331 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PR80 420 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF716A6NP11 495 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SNURFLB1AK76 121 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SPRY3O43610 288 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GNG7O60262 68 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MPC2O95563 127 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CELA2AP08217 269 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HLA-GP17693 338 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NMUP48645 174 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MFAP4P55083 255 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NAAAQ02083 359 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HERPUD1Q15011 391 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms