RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

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Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM159Q96B96 161 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 C19orf60Q96EN9 201 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SMIM8Q96KF7 97 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GLT1D1Q96MS3 346 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 METTL26Q96S19 204 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 LINC01587Q99440 93 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PITX2Q99697 317 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SRRQ9GZT4 340 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 VCX3BQ9H321 246 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GOLPH3Q9H4A6 298 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 C11orf49Q9H6J7 331 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 C6orf50Q9HD87 102 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SDHAF3Q9NRP4 125 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 UBQLN4Q9NRR5 601 aa0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 CD300AQ9UGN4 299 aa0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 V9GYY9 64 aa0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 CACNA1BQ00975 2339 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa0.04□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 MED12Q93074 2177 aa0.04□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 USP24Q9UPU5 2620 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 POLEQ07864 2286 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 NCKAP5O14513 1909 aa0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 USH2AO75445 5202 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TTC28Q96AY4 2481 aa0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 hCG_2039718K7EN88 272 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 M0QXV9 152 aa0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 SPOPO43791 374 aa0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 IGKV1-16P04430 117 aa0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 STAG3L2P0CL84 134 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 LIMS3P0CW19 117 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 LIMS4P0CW20 117 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 P0DMU3 169 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 FAM231AP0DMU4 169 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 FAM231CP0DMU5 169 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PRPS1L1P21108 318 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ALDH3A1P30838 453 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 UGT2B10P36537 528 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MAGEA3P43357 314 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 OR1E2P47887 323 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PSMB3P49720 205 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 NUDT2P50583 147 aa0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 RBM11P57052 281 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
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SNORD71-201ENST00000411292 HBG1P69891 147 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 HBG2P69892 147 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 IFFO1Q0D2I5 559 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GPR176Q14439 515 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 OR4D1Q15615 310 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TRAM1Q15629 374 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 C4orf26Q17RF5 130 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM249Q2WGJ8 235 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 BSXQ3C1V8 233 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ACTBL2Q562R1 376 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MESTQ5EB52 335 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 OR10J3Q5JRS4 329 aa0.03□□□□□ -2.4
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