RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZTI0 123 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35F6Q8N357 371 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF133Q8WVZ7 376 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDKL2Q92772 493 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM6SF2Q9BZW4 377 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRLF2Q9HC73 371 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHRS12A0PJE2 317 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MUN3 132 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGF16O43320 207 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 LY6HO94772 140 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPNP16150 400 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERHP84090 104 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR11H1Q8NG94 326 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6N2Q8NGY6 317 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX13Q92968 403 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 MGLLQ99685 303 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 EBPLQ9BY08 206 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYSTM1Q9H1C7 97 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 C16orf95Q9H693 158 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAUS4Q9H6D7 363 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKHQ9HCJ1 492 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANGPT4Q9Y264 503 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 C11orf86A6NJI1 115 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 B4DEV8 164 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 J3QLI3 93 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GMDSO60547 372 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIMD1P0DJR0 217 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A16P16260 332 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRMP19623 302 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF90Q03938 601 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RELAQ04206 551 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAXQ07812 192 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 HES3Q5TGS1 186 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASCL4Q6XD76 172 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00523Q86TU6 105 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR9I1Q8NGQ6 314 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6K2Q8NGY2 324 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 LHFPL5Q8TAF8 219 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUN5Q8TC36 379 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 UPK3BQ9BT76 320 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 COPS4Q9BT78 406 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF426Q9BUY5 554 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 MND1Q9BWT6 205 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXL15Q9H469 300 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 XKR8Q9H6D3 395 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBN2P35556 2912 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLUHO75153 1309 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9J4A7 227 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 H3BPC8 53 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 MBP02144 154 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBP1P09467 338 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GABARAPL2P60520 117 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35A2P78381 396 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDK2Q15119 407 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASL11AQ6T310 242 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4K17Q8NGC6 315 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 DTD1Q8TEA8 209 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGF13Q92913 245 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GALMQ96C23 342 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAAP24Q9BTP7 215 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCML1Q9UN30 329 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNIKQ9UKE5 1360 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM64CA6NLI5 447 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf74A8MZ97 194 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBDO15205 165 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNRH2O43555 120 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL9P15248 144 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPOP30536 169 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEKP35659 375 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GBE1Q04446 702 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC38A11Q08AI6 406 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms