RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PRRX1P54821 245 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LOXL3P58215 753 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PROK1P58294 105 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SHISA2Q6UWI4 295 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 NR2C2APQ86WQ0 139 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR1L1Q8NH94 360 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 NEDD4LQ96PU5 975 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GFOD1Q9NXC2 390 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0B4J203 849 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM30A4D0T7 59 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LDLRAD4O15165 306 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SOCS1O15524 211 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 HBZP02008 142 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GALP22466 123 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MYL9P24844 172 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 NEDD8Q15843 81 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZPA2 131 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PRR18Q8N4B5 295 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR51E2Q9H255 320 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RAB18Q9NP72 206 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PDCD5O14737 125 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SLC31A2O15432 143 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CA11O75493 328 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RAB3BP20337 219 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf183Q5T699 404 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TOMM40LQ969M1 308 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 STUB1Q9UNE7 303 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 IFITM5A6NNB3 132 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 H3BUI4 141 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SPINT2O43291 252 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CEACAM3P40198 252 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 VEGFCP49767 419 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PSMD7P51665 324 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 EFNB2P52799 333 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM50BP56557 158 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GNMTQ14749 295 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RPEQ96AT9 228 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF702PQ9H963 129 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.97□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPI3 338 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OOSP1A8MZH6 123 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DS4P43632 304 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MADCAM1Q13477 382 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZS46 218 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00311Q8N616 119 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CITED1Q99966 193 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PECRQ9BY49 303 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GNG12Q9UBI6 72 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 AK3Q9UIJ7 227 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM23O14925 209 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 NAPSAO96009 420 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 GADD45AP24522 165 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 BRS3P32247 399 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 REG1BP48304 166 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF134P52741 427 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HMGN3Q15651 99 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR56B4Q8NH76 319 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CFHR4Q92496 578 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms