RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 RSG1Q9BU20 258 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 NMES1Q9C002 83 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 WNT9BO14905 357 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ECSCRQ19T08 205 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 LYG1Q8N1E2 194 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 PP6455Q8WZ26 134 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 FUT9Q9Y231 359 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PQM1 296 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SELENOFO60613 162 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 MPC2O95563 127 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 KRASP01116 189 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GLI4P10075 376 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SLC6A1P30531 599 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 DLK1P80370 383 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 AESQ08117 197 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SPTA1P02549 2419 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 A0A0A6YYD5 115 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 DIRC3C9JPN6 131 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 NKX2-2O95096 273 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ETHE1O95571 254 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GAMTQ14353 236 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GGACTQ9BVM4 153 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 MED29Q9NX70 200 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 RABAC1Q9UI14 185 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ZNF253O75346 499 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GYPAP02724 150 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 FABP2P12104 132 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 BSXQ3C1V8 233 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TEX30Q5JUR7 227 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 COX20Q5RI15 118 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ZNF511Q8NB15 262 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 NAT8Q9UHE5 227 aa6.84□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 H3BVH4 76 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 NGFP01138 241 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 C1QAP02745 245 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 SLC25A6P12236 298 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 EPHA2P29317 976 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 PSMB2P49721 201 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 ZNF117Q03924 483 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 OR51H1Q8NH63 302 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 SMIM19Q96E16 107 aa6.84□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 B4DSR2 109 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 LILRA1O75019 489 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 HAND1O96004 215 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 IGF2P01344 180 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 FGF2P09038 288 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 LIMS3P0CW19 117 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 LIMS4P0CW20 117 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 ZNF32P17041 273 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 ATF1P18846 271 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 CXCL3P19876 107 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 DHODHQ02127 395 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 RPEL1Q2QD12 228 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 TMEM104Q8NE00 496 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 NTNG2Q96CW9 530 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 CACNA1EQ15878 2313 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 OR5G3P0C626 314 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 GCSHP23434 173 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 BANF2Q9H503 90 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 IL36GQ9NZH8 169 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 ADAP1O75689 374 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 PRDX4Q13162 271 aa6.83□□□□□ -1.32
USP3-201ENST00000268049 DHRS2Q13268 280 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms