RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GzmbP04187 247 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Saa2P05367 122 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rtn4rl2Q7M6Z0 420 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem127Q8BGP5 238 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmprss11gQ8BZ10 417 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rft1Q8C3B8 541 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pnpla3Q91WW7 413 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eef1akmt1Q9CY45 214 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem50bQ9D1X9 158 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf593Q9DB42 134 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc2a8Q9JIF3 477 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm42543A0A0G2JET4 117 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm17655A0A1B0GT13 591 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr324Q5NCC7 333 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ToxQ66JW3 526 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q6DIA7 600 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc25a47Q6IS41 310 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Thap4Q6P3Z3 569 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Neil1Q8K4Q6 389 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc167Q9D162 97 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SclyQ9JLI6 432 aa11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sult2a3D3Z1W5 285 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r174E9PYW5 313 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm20708H3BKF4 155 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr339Q8VGK8 309 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dyrk3Q922Y0 586 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rps2-ps6A0A140T8L5 221 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr194L7N1Y8 306 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr203L7N205 307 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gosr2O35166 212 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mpv17P19258 176 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Col8a2P25318 699 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Diras2Q5PR73 199 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rpl35Q6ZWV7 123 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mitd1Q8VDV8 249 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q9DAZ5 108 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr878Q9EQA9 314 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1264Q9R0K2 308 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 S100a6P14069 89 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rac2Q05144 192 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxw16Q497Z0 464 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PiglQ5SX19 252 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Inca1Q6PKN7 231 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp455Q7M6X9 461 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp189Q8BKP2 608 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lsm11Q8BUV6 361 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wipi1Q8R3E3 446 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CenpmQ9CQA0 180 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klrc3Q9QXN7 221 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcne4Q9WTW3 170 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21761J3QK00 171 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ms4a18J3QN01 344 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21833J3QPK1 500 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r58K7N6V2 862 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AanatO88816 205 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GipP48756 144 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hmga2P52927 108 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q3TEI4 1023 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbrg1Q3UB74 406 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mtch1Q791T5 389 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1309Q8VF83 320 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1240Q8VG73 314 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Batf3Q9D275 118 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trappc6bQ9D289 158 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr944Q9EQ91 311 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Map1aQ9QYR6 2776 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21560D3Z7A4 205 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm20715E9Q3L7 95 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CckarO08786 436 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 EhfO70273 300 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GzmeP08884 248 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 UbbP0CG49 305 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CtsbP10605 339 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hnf1aP22361 628 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gng2P63213 71 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam71f1Q3UZD7 341 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1301Q8VGE7 312 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ropn1lQ9EQ00 218 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm17087V9GXQ2 156 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem8bB1AWJ5 472 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prdm13E9PZZ1 754 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r173E9Q8V7 313 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr417F8VQB1 309 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Htr5aP30966 357 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pla2g2cP48076 150 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rce1P57791 329 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mpc1P63030 109 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gng3P63216 75 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1507Q0VEP0 313 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GcdhQ60759 438 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dtx1Q61010 627 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms