RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sav1Q8VEB2 386 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Utp23Q9CX11 249 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trem1Q9JKE2 230 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr203L7N205 307 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fpr2O88536 351 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AhrP30561 848 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtgfrP43117 366 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr775Q7TRI4 312 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LiphQ8CIV3 451 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr472Q8VG43 310 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il24Q925S4 181 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lims1Q99JW4 325 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd12Q99LR1 398 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc18a3O35304 530 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpusd3Q14AI6 344 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gls2Q571F8 602 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1287Q7TQY1 305 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem221Q8K071 230 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr214Q8VG27 320 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lcn8Q924P3 175 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp5sQ9CRA7 200 aa11.32□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5225J3QPL3 108 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3U1D9 316 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tdpoz5Q6YCH1 340 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Obp2aQ8K1H9 176 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r222Q8R269 308 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mitd1Q8VDV8 249 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnase2bQ9QY48 354 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr896-ps1A0A1L1SRZ8 308 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr267A2AM35 313 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r138D3YTY2 306 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam53aE9PV82 402 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8693E9PW18 306 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr544E9PX47 334 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10097J3KMK7 105 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4498K9J7G4 306 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r118L7N273 306 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnih1O35372 144 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox5aP12787 146 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhbdd1Q8BHC7 315 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MrgprgQ91ZB5 289 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610524H06RikQ9CZU9 139 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D930007J09RikQ9D2K6 131 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r44Q9EQ47 310 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekha3Q9ERS4 297 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspan32Q9JHH2 256 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Npas3Q9QZQ0 925 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-54A0A075B5W5 117 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btbd35f28A2CFD5 498 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LipiF6YQT7 476 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gfra3O35118 397 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lmx1bO88609 395 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htr2aP35363 471 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11aP62492 216 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcf7Q00417 419 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ascl1Q02067 231 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpeb3Q7TN99 716 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 JkampQ8BI36 311 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10600Q8BQ57 223 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Naa40Q8VE10 237 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RangrfQ9JIB0 185 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp16Q9WTR0 607 aa11.31□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm38303A0A0A6YWW8 100 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr911-ps1A0A140T8K0 311 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem182B2RVY9 229 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r82G3UWA2 865 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp4bP50992 294 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KcnrgQ2TUM3 264 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rph3alQ768S4 302 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp954Q7TNU5 416 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnk1Q99ML2 666 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NtmQ99PJ0 344 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sgo1Q9CXH7 517 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AhspQ9CY02 102 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arpc5lQ9D898 153 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cryba2Q9JJV1 197 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psg20E9Q9B4 475 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1131Q7TR45 309 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem255aQ8BHW5 351 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrtm1Q8K377 522 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxc12Q8K5B8 280 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem205Q91XE8 189 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfrsf19Q9JLL3 416 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam208bQ5DTT3 2382 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd12G5E893 2041 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp707F6QUN2 391 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21721J3QMK7 227 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CryzP47199 331 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam57aQ5ND56 257 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il12rb1Q60837 738 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1058Q7TR74 316 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dtx2Q8R3P2 619 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr512Q8VFZ4 326 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr483Q8VG05 315 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1132Q8VG97 308 aa11.3□□□□□ -0.6
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BmfQ91ZE9 185 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms