RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 OCSTAMPQ9BR26 566 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TM2D1Q9BX74 207 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 LINC00470Q9BZP3 86 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 NMES1Q9C002 83 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CHST5Q9GZS9 411 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MFFQ9GZY8 342 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ARL6Q9H0F7 186 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 PPA2Q9H2U2 334 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 IFT46Q9NQC8 304 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CENPMQ9NSP4 180 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 RASL12Q9NYN1 266 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 COMMD9Q9P000 198 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TAAR3PQ9P1P4 343 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 V9GYS6 101 aa4.9□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A1B0GUS0 222 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 C9orf170A2RU37 121 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 SRRM5B3KS81 715 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 SSX5O60225 188 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 DHRS3O75911 302 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 IGHV2-70P01814 119 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 IFNA6P05013 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 QDPRP09417 244 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 PATE4P0C8F1 98 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 LYL1P12980 280 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CPT2P23786 658 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CSNK1A1P48729 337 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 LOXL3P58215 753 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CDNFQ49AH0 187 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM27BQ5VT28 67 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 UQCC3Q6UW78 93 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 DRAM2Q6UX65 266 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MOB3CQ70IA8 216 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM17Q86X19 198 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ANGPTL5Q86XS5 388 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM123Q8N131 208 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 STPG2Q8N412 459 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 BVESQ8NE79 360 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 OR8S1Q8NH09 359 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 OR4F5Q8NH21 305 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TERB2Q8NHR7 220 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ST8SIA2Q92186 375 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 NABP1Q96AH0 204 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB3CQ96E17 227 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TECTBQ96PL2 329 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 KCNK15Q9H427 330 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 RGCCQ9H4X1 137 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB18Q9NP72 206 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 GPR84Q9NQS5 396 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 DECR2Q9NUI1 292 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 RDH8Q9NYR8 311 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 DUSP13Q9UII6 198 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 VSIG4Q9Y279 399 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 RNF114Q9Y508 228 aa4.89□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 VSTM5A8MXK1 200 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 F8VVB4 439 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 F8VWA3 439 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 M0QYG6 137 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 DHHO43323 396 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 PET100P0DJ07 73 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 CCL2P13500 99 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF250P15622 560 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 HRH1P35367 487 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 PMELP40967 661 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC6A9P48067 706 aa4.88□□□□□ -1.63
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF84P51523 738 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms