RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1B1O43704 296 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR9P51686 369 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 FDX2Q6P4F2 183 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SATL1Q86VE3 508 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8J1Q8NGP2 316 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL11Q969Q4 196 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 CITED4Q96RK1 184 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 VSIG4Q9Y279 399 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QLW9 94 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 OVOL1O14753 267 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A6O15403 523 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-43DP0DP04 118 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SPNP16150 400 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF19P17023 458 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 MYF6P23409 242 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 RSU1Q15404 277 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPHD1Q5U4P2 390 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ELP2Q6IA86 826 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5D14Q8NGL3 314 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 DCUN1D4Q92564 292 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2E2Q96LR5 201 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF1P05019 195 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 GZMHP20718 246 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 F2RL1P55085 397 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 GNB1P62873 340 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00311Q8N616 119 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 SUMF2Q8NBJ7 301 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM104Q8NE00 496 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 PXT1Q8NFP0 134 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 CIB1Q99828 191 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK15Q9H2R5 256 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 WSB1Q9Y6I7 421 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH1Q9P2D7 4330 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 I3L521 148 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB3O15480 346 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR3BO95264 441 aa21.26■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PAX5Q02548 391 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA12Q8IW75 414 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF491Q8N8L2 437 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.26■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C45A6NMZ5 311 aa21.25■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 MYOZ3Q8TDC0 251 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC107Q8WV48 283 aa21.25■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 ISOC1Q96CN7 298 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf36Q96KX1 117 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GFOD1Q9NXC2 390 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRPO00591 440 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MMDQ15546 238 aa21.24■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 DNAL1Q4LDG9 190 aa21.24■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 NEK7Q8TDX7 302 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PELI1Q96FA3 418 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP11Q9NR21 331 aa21.24■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF581Q9P0T4 197 aa21.24■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 TXNL1O43396 289 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 RUNX1Q01196 453 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 GHITMQ9H3K2 345 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 IMPAD1Q9NX62 359 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 ST3GAL6Q9Y274 331 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 G3V318 75 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC31A2O15432 143 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3AP20336 220 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf31Q8N9H6 132 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf65H3BRN8 121 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP8B1O43520 1251 aa21.21■□□□□ 0.99
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