RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MPIG6B	O95866	241 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	GZMH	P20718	246 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CD24	P25063	80 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	GFI1	Q99684	422 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179		J3QR06	171 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	AIP	O00170	330 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	UBB	P0CG47	229 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CD37	P11049	281 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FUT3	P21217	361 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	HTR2C	P28335	458 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CEACAM3	P40198	252 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	GNG10	P50151	68 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FABP5	Q01469	135 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TRAM1	Q15629	374 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CST11	Q9H112	138 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MMP28	Q9H239	520 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1W2PPE3	182 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	BRS3	P32247	399 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	EFNB2	P52799	333 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SSX1	Q16384	188 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	VWF	P04275	2813 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	SLC22A1	O15245	554 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	ORC5	O43913	435 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	PDCD6	O75340	191 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	GLA	P06280	429 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	BLCAP	P62952	87 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	QRFP	P83859	136 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	UNC119	Q13432	240 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	P2RY14	Q15391	338 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179		Q6ZS46	218 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	RPE	Q96AT9	228 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179		Q9H521	79 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	BPNT1	O95861	308 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PNKP-223	ENST00000629179	LOXL3	P58215	753 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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