RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 CBX5P45973 191 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 ERVFRD-1P60508 538 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 LCN2P80188 198 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 UTF1Q5T230 341 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 SETD6Q8TBK2 473 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 MMP26Q9NRE1 261 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 AKAP9Q99996 3911 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 LOC105371242A0A075B767 164 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 FUOMA2VDF0 154 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 H7C1Q1 480 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 MMP23AO75900 390 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 GSTT2P0CG29 244 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 GSTT2BP0CG30 244 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 GLP1RP43220 463 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 HERPUD1Q15011 391 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 FAM185AQ8N0U4 392 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 BEST4Q8NFU0 473 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 OR1L1Q8NH94 360 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00574Q9H8X3 128 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 TAF9BQ9HBM6 251 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00312Q9Y6C7 94 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC168Q8NDH2 2452 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 RBBP9O75884 186 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 RCVRNP35243 200 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 SSTR5P35346 364 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 HLA-DRB3P79483 266 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 MOB1BQ7L9L4 216 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC32Q9BV29 185 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 OR6C3Q9NZP0 311 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG3-202ENST00000617158 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1W2PQ09 198 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 hADV38S2A0JD32 116 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TRDCB7Z8K6 153 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 RFESDQ8TAC1 157 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 LPAR2Q9HBW0 351 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 IFT46Q9NQC8 304 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 CALYQ9NYX4 217 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ANXA10Q9UJ72 324 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 FOXH1O75593 365 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 UPK1BO75841 260 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 HBZP02008 142 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PPIAL4GP0DN37 164 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 IGSF11Q5DX21 431 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 Q8N7P7 452 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM229BQ8NBD8 167 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR4D10Q8NGI6 311 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF286AQ9HBT8 521 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TAS2R3Q9NYW6 316 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ITPR3Q14573 2671 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 C17orf98A8MV24 154 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PLA2G10O15496 165 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 FABP7O15540 132 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 CD74P04233 296 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 CD3DP04234 171 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF728P0DKX0 622 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV4-31P0DP07 118 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 GZMHP20718 246 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 HLA-DMAP28067 261 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ACTBP60709 375 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ACTG1P63261 375 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 C6orf183Q5T699 404 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 CD276Q5ZPR3 534 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF554Q86TJ5 538 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF565Q8N9K5 539 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ARL11Q969Q4 196 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 CABLES2Q9BTV7 478 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ABCB10Q9NRK6 738 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OPN4Q9UHM6 478 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 M0QYG6 137 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 F2RL2O00254 374 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OMGP23515 440 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 DLX1P56177 255 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 STEAP3Q658P3 488 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR5AP2Q8NGF4 316 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KIRREL1Q96J84 757 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF714Q96N38 554 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms