RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF260Q3ZCT1 412 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF320A2RRD8 509 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM229AB2RXF0 380 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 PLAC9Q5JTB6 97 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf185Q5T7R7 199 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 TPRX1Q8N7U7 411 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 NIT2Q9NQR4 276 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 OR1A1Q9P1Q5 309 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PN81 502 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 G3V3Q6 166 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CCL21O00585 134 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNA7P36544 502 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFA6Q01524 100 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 GHITMQ9H3K2 345 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 POLEQ07864 2286 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 VSIG10L2P0DP72 767 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CEACAM3P40198 252 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35B3Q9H1N7 401 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPM7Q96QT4 1865 aa17.96■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 GDF9O60383 454 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRA6Q16445 453 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSM6Q6P461 480 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00596Q86U02 117 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM157AC9JC47 383 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V1FQ16864 119 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10G4Q8NGN3 311 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10G9Q8NGN4 311 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10G7Q8NGN6 311 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 VSTM2AQ8TAG5 236 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 DTD1Q8TEA8 209 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CTRB1P17538 263 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FGF12P61328 243 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM3AP98173 230 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 VAX1Q5SQQ9 334 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CTRB2Q6GPI1 263 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRS9Q9BPW9 319 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RAMP1O60894 148 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 H3F3AP84243 136 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF154Q13106 437 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ESPL1Q14674 2120 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TOX4O94842 621 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF561Q8N587 486 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 G6PC2Q9NQR9 355 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FBP1P09467 338 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NTF3P20783 257 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ERVFC1-1P60608 527 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF441Q8N8Z8 693 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD36A6QL64 1941 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TGOLN2O43493 480 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 Q56UQ5 140 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TXN2Q99757 166 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RLFQ13129 1914 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 UCNP55089 124 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NPIPB13A6NJU9 1138 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NPIPB4C9JG80 1138 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 B3GALNT1O75752 331 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RFPL3SP0C7P2 107 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDX2P32119 198 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTCAP3Q53RY4 240 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CLRN3Q8NCR9 226 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CDRT15L2A8MXV6 281 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 IGSF11Q5DX21 431 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ETFRF1Q6IPR1 90 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 Q9N2K0 584 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 MMP24Q9Y5R2 645 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 PSG2P11465 335 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ACP1P24666 158 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 WIPI2Q9Y4P8 454 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TNXAQ16473 311 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC45A2Q9UMX9 530 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC37A2A6NM11 1700 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF737O75373 536 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RHOBP62745 196 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 DOK5Q9P104 306 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 PRF1P14222 555 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 G6PCP35575 357 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF12L2Q5VW00 463 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ANK1P16157 1881 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8B3Q8NGG8 313 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT2BQ93097 391 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8B2Q96RD0 313 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms