RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAB25P57735 213 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PAFAH1B2P68402 229 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C5orf64Q2M2E5 130 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAJINQ3KP22 176 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR10K2Q6IF99 312 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RASL11AQ6T310 242 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C7orf65Q6ZTY9 151 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DCXRQ7Z4W1 244 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CYP4Z1Q86W10 505 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LINC01587Q99440 93 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UPK3BQ9BT76 320 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PKIBQ9C010 78 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VCX3BQ9H321 246 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HHLA3Q9XRX5 114 aa-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SBNO1A3KN83 1393 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NRCAMQ92823 1304 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DFFAO00273 331 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COCHO43405 550 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ALOX12BO75342 701 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FCN3O75636 299 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRT34O76011 436 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GCGP01275 180 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDK10Q15131 360 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MOGQ16653 247 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CASC1Q6TDU7 716 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CYGBQ8WWM9 190 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAAP24Q9BTP7 215 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDCA4Q9BXL8 241 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KLF12Q9Y4X4 402 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM215AQ9Y5M1 114 aa-0.77□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NAV1Q8NEY1 1877 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PGPA6NDG6 321 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 M0QXV9 152 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RNF13O43567 381 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TCF21O43680 179 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGKV1D-12P01611 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STOMP27105 288 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANKDD1AQ495B1 522 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CEP55Q53EZ4 464 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TEX36Q5VZQ5 186 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 APRG1Q8IVJ8 170 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR52E5Q8NH55 327 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANGPTL6Q8NI99 470 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AMELYQ99218 206 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MIEN1Q9BRT3 115 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GOLPH3Q9H4A6 298 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRABDQ9H4I3 376 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD209Q9NNX6 404 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CFL2Q9Y281 166 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ALG5Q9Y673 324 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.78□□□□□ -2.53
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.78□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A087WX48 190 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C9J4A7 227 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 K7EQS6 105 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJB6O75190 326 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR2F2O95006 317 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SERPINA7P05543 415 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UCHL1P09936 223 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF728P0DKX0 622 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD9P21926 228 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LGALS9BQ3B8N2 356 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR4C5Q8NGB2 326 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCL17Q92583 94 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FMC1Q96HJ9 113 aa-0.79□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms