RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TEX38Q6PEX7 206 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ERGIC1Q969X5 290 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 SERPINE3A8MV23 424 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 P2RY10O00398 339 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TRAPPC6AO75865 159 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 PAX1P15863 534 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 PIGPP57054 158 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 FXYD4P59646 89 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 KRTDAPP60985 99 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 LCN15Q6UWW0 184 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 APH1AQ96BI3 265 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 IMMP2LQ96T52 175 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 GJE1A6NN92 205 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM225BP0DP42 221 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 RAC2P15153 192 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF43P17038 809 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 LGALS4P56470 323 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 EGR4Q05215 589 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 FAM69BQ5VUD6 431 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 STARD4Q96DR4 205 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 OR6C1Q96RD1 312 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CACNA1CQ13936 2221 aa5.2□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 OR2J2O76002 312 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CLPSP04118 112 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TNFSF4P23510 183 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 HBG1P69891 147 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 HBG2P69892 147 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MPV17LQ2QL34 196 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF519Q8TB69 540 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 RBKSQ9H477 322 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CDH20Q9HBT6 801 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 RAD51DO75771 328 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 IGHEP01854 428 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 BIDP55957 195 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TAS2R30P59541 319 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 LCN2P80188 198 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ICAM4Q14773 271 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 MSMO1Q15800 293 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 EXT1Q16394 746 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 LHX4Q969G2 390 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 NAA60Q9H7X0 242 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 VDAC3Q9Y277 283 aa5.19□□□□□ -1.58
SEH1L-210ENST00000592582 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms