RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 GNB4Q9HAV0 340 aa10.17□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.17□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.17□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 J3QLW9 94 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 GYG2O15488 501 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 OR5H8P0DN80 308 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV3-43DP0DP04 118 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF19P17023 458 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 MYF6P23409 242 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 GNB1P62873 340 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF616Q08AN1 781 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 TMED1Q13445 227 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 IL13RA2Q14627 380 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 RSU1Q15404 277 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP6AP1Q15904 470 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 FDX2Q6P4F2 183 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 SATL1Q86VE3 508 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM104Q8NE00 496 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 OR5D14Q8NGL3 314 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 C4orf36Q96KX1 117 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 GPER1Q99527 375 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 POMPQ9Y244 141 aa10.16□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 OR4C45A6NMZ5 311 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 GABRPO00591 440 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 IGF1P05019 195 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 SPNP16150 400 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 CD1BP29016 333 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNJ3P48549 501 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 CCR9P51686 369 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 F2RL1P55085 397 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ELP2Q6IA86 826 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF429Q86V71 674 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC107Q8WV48 283 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ARL11Q969Q4 196 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 PELI1Q96FA3 418 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 KLK15Q9H2R5 256 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 VSIG4Q9Y279 399 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 WSB1Q9Y6I7 421 aa10.15□□□□□ -0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.15□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 OVOL1O14753 267 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC31A2O15432 143 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 MAGEB3O15480 346 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 HTR3BO95264 441 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 GP9P14770 177 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 PAX5Q02548 391 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 PXT1Q8NFP0 134 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 NEK7Q8TDX7 302 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 DCUN1D4Q92564 292 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 CITED4Q96RK1 184 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 GABARAPL3Q9BY60 117 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 PARP11Q9NR21 331 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 IMPAD1Q9NX62 359 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 DHDHQ9UQ10 334 aa10.14□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAH7Q8WXX0 4024 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 G3V318 75 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 C15orf65H3BRN8 121 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 I3L521 148 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 TXNL1O43396 289 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 RAB3AP20336 220 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 GZMHP20718 246 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 MMDQ15546 238 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00311Q8N616 119 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ISOC1Q96CN7 298 aa10.13□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 AIPO00170 330 aa10.12□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP6V0E1O15342 81 aa10.12□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP8B1O43520 1251 aa10.12□□□□□ -0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 CDRT1O95170 752 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms