RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-230ENST00000590638 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 SPERTQ8NA61 448 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 NUP37Q8NFH4 326 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OR51F2Q8NH61 342 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 YIPF5Q969M3 257 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TM2D1Q9BX74 207 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 BANF2Q9H503 90 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 C1RLQ9NZP8 487 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.51□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ESPL1Q14674 2120 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 A0A1W2PP11 408 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 LRP5LA4QPB2 252 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 DPRXA6NFQ7 191 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM210A6NLX4 147 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CENPXA8MT69 81 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 PRSS44E7EML9 344 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 J3QR06 171 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 UBE2CO00762 179 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 AKR7A2O43488 359 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ANGPTL7O43827 346 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 RBBP9O75884 186 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 IGHV3-13P01766 116 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CD3GP09693 182 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 HAAOP46952 286 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 AP3S2P59780 193 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CD81P60033 236 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 IL24Q13007 206 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OXA1LQ15070 435 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CDNFQ49AH0 187 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 BIVMQ86UB2 503 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CALHM1Q8IU99 346 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OSR2Q8N2R0 312 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF611Q8N823 705 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ACBD4Q8NC06 268 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CHST4Q8NCG5 386 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM104Q8NE00 496 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 Q8NFD4 153 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OR52I2Q8NH67 350 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 GAL3ST1Q99999 423 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 PKIBQ9C010 78 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 RHOFQ9HBH0 211 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 KALRNO60229 2985 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 PTPN13Q12923 2485 aa6.5□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 A0A1B0GWJ7 208 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 H7C417 338 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 J3QT63 122 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 OVOL3O00110 214 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ABCD4O14678 606 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 PLA2G10O15496 165 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 LYRM1O43325 122 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 LANCL1O43813 399 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ORC5O43913 435 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 IGKV1D-12P01611 117 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 MELTFP08582 738 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 MPZP25189 248 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 BSPH1Q075Z2 132 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 ELP2Q6IA86 826 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NEDD4L-230ENST00000590638 GPX8Q8TED1 209 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms