RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ING4Q9UNL4 249 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP250Q9BV73 2442 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIOO75962 3097 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PCSK5Q92824 1860 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GUH1 482 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CIB4A0PJX0 185 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 H7C417 338 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 L7N2F9 121 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 P2RY10O00398 339 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NBR2O15453 112 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SSNA1O43805 119 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RAD1O60671 282 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM4O75871 244 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB6O95139 128 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TGM6O95932 706 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYAAP02489 173 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 APOC1P02654 83 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TTRP02766 147 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSM4P0C7M7 580 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAIN1P0CW23 69 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G2AP14555 144 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRA1P14867 456 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SELEP16581 610 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TCN2P20062 427 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB3AP20336 220 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MSR1P21757 451 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS3P35030 304 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SAA4P35542 130 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CCR6P51684 374 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PAX9P55771 341 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R19P59542 299 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 IFITM2Q01629 132 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FCN2Q15485 313 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2V2Q15819 145 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM189A2Q15884 450 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2A1Q16548 175 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST3H3Q16695 136 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GSG1Q2KHT4 349 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf128Q5T292 105 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PGAP1Q75T13 922 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM17Q86X19 198 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HOGA1Q86XE5 327 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NAXDQ8IW45 347 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6N1Q8NGY5 312 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CT55Q8WUE5 264 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM54Q969K7 222 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF170Q96K19 258 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HYLS1Q96M11 299 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 GLTPQ9NZD2 209 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SDK1Q7Z5N4 2213 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TECTAO75443 2155 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SDK2Q58EX2 2172 aa3.44□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C15orf61A6NNL5 157 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM25EA8MYX2 175 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 C21orf140B9A014 251 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 G3V3Y1 287 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFSF11O14788 317 aa3.43□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
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