RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 SIGLEC5O15389 551 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PSPNO60542 156 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PDCD6O75340 191 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FSTL3O95633 263 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 IGHV2-5P01817 119 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 WNT2P09544 360 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.97□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 KIR3DS1Q14943 382 aa6.97□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 SNX22Q96L94 193 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 CLN8Q9UBY8 286 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF69Q9UC07 566 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-218ENST00000587547 CNIH2Q6PI25 160 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 Q6ZTK2 550 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 OR8H2Q8N162 312 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-218ENST00000587547 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 RAB3CQ96E17 227 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 PECRQ9BY49 303 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 ABCG5Q9H222 651 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 MMP27Q9H306 513 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-218ENST00000587547 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 RYR3Q15413 4870 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-218ENST00000587547 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 H3BUI4 141 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 MGST3O14880 152 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 CLPXO76031 633 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 SCGNO76038 276 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 TGFAP01135 160 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 CD3GP09693 182 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-218ENST00000587547 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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