RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	COQ2	Q96H96	371 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312		Q96M66	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312		A0A1B0GUS0	222 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312		A0A1W2PP11	408 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	GPR137B	O60478	399 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	NDUFA7	O95182	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	IL1A	P01583	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	BRS3	P32247	399 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	MNDA	P41218	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	P2RY14	Q15391	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SSX1	Q16384	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SSX3	Q99909	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	VWF	P04275	2813 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312		H3BUX3	64 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	F2RL2	O00254	374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	ORC5	O43913	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	GADD45A	P24522	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	PAX6	P26367	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	IL3RA	P26951	378 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RAG2	P55895	527 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SSX2	Q16385	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	LTC4S	Q16873	150 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	MT-ND4	P03905	459 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	CD36	P16671	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	HES5	Q5TA89	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312		Q6ZSV7	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RPE	Q96AT9	228 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-208	ENST00000586312	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	RGS11	O94810	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	CD34	P28906	385 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-208	ENST00000586312	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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