RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551901.5

RRN3P1-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RRN3P1, Length 1,157 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-204ENST00000551901 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 LEUTXA8MZ59 168 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 J3QR06 171 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 GLAP06280 429 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MGMTP16455 207 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 CPEP16870 476 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 GZMHP20718 246 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 GABRA5P31644 462 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SSTR5P35346 364 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 GLP1RP43220 463 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MAP2K4P45985 399 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 PRRX1P54821 245 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 OR9G1Q8NH87 305 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 RFESDQ8TAC1 157 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 UFD1Q92890 307 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 CYYR1Q96J86 154 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 CNBD2Q96M20 576 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 GFI1Q99684 422 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MGLLQ99685 303 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 BANF2Q9H503 90 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF702PQ9H963 129 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 PSG11Q9UQ72 335 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 OOSP1A8MZH6 123 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TOR1AO14656 332 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC22A1O15245 554 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 ORC5O43913 435 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 VSIG8P0DPA2 414 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 VHLP40337 213 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 LOXL3P58215 753 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 QRFPP83859 136 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TRAM1Q15629 374 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 FBLN7Q53RD9 439 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 C11orf88Q6PI97 169 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 Q6ZS46 218 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM219Q86XT9 240 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM203Q969S6 136 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MMP28Q9H239 520 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3P1-204ENST00000551901 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 F2RL2O00254 374 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CA11O75493 328 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 UBBP0CG47 229 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 HSMCR30P0CW71 290 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 FUT3P21217 361 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CD24P25063 80 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 NFYBP25208 207 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 BRS3P32247 399 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CEACAM3P40198 252 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 BLCAPP62952 87 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 SSX1Q16384 188 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 OR10K2Q6IF99 312 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 RAB12Q6IQ22 244 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 TREML4Q6UXN2 200 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 LINC00311Q8N616 119 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 DTX3Q8N9I9 347 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CCDC107Q8WV48 283 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CFHR4Q92496 578 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 LEAP2Q969E1 77 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 TM2D1Q9BX74 207 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.33□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 C12orf77C9JDV5 145 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 AIPO00170 330 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 TIMM23O14925 209 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 PDCD6O75340 191 aa8.32□□□□□ -1.08
RRN3P1-204ENST00000551901 IGHV3-7P01780 117 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms