RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 MYDGFQ969H8 173 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TOMM40LQ969M1 308 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ABCG5Q9H222 651 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 GAB2Q9UQC2 676 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 H3BUA1 57 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 AP4M1O00189 453 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 EI24O14681 340 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RBBP9O75884 186 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TPPPO94811 219 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 CD33P20138 364 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 CDK2P24941 298 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ATP6V1E1P36543 226 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 THBS3P49746 956 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 DRAM1Q8N682 238 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 NDNFQ8TB73 568 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TM2D1Q9BX74 207 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 S100A14Q9HCY8 104 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PSMB11A5LHX3 300 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 A8MZ25 164 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 NDUFA3O95167 84 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 SPDEFO95238 335 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 HLA-DRB1P01911 266 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TFF1P04155 84 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 BDKRB2P30411 391 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 GDNFP39905 211 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 DOC2BQ14184 412 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 LY6EQ16553 131 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 Q499Y3 187 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TTC23Q5W5X9 447 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RPEQ96AT9 228 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC29A1Q99808 456 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 HSD17B6O14756 317 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 YPEL1O60688 119 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 MMP23AO75900 390 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 CHATP28329 748 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 VHLP40337 213 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PPP3R1P63098 170 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TRAM1Q15629 374 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 KLK9Q2XQG4 91 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM209BQ5JX69 171 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 SUMF2Q8NBJ7 301 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PTX4Q96A99 478 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 YPEL2Q96QA6 119 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 BABAM2Q9NXR7 383 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 CKLFQ9UBR5 152 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 MOSP00540 346 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 IGLV1-40P01703 118 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 MT-ND4P03905 459 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 FGF2P09038 288 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 GTF2F2P13984 249 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 HMGN3Q15651 99 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TEX38Q6PEX7 206 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 STPG2Q8N412 459 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 STX19Q8N4C7 294 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms