RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GPR137B	O60478	399 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CA11	O75493	328 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GLA	P06280	429 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CD36	P16671	472 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PAX6	P26367	422 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CEACAM3	P40198	252 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GNG10	P50151	68 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	UNC119	Q13432	240 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LY6E	Q16553	131 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GFI1	Q99684	422 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	F2RL2	O00254	374 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SPINT2	O43291	252 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MT-ND4	P03905	459 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GDNF	P39905	211 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RAG2	P55895	527 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR10A3	P58181	314 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ATR	Q13535	2644 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CHAT	P28329	748 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CD34	P28906	385 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	AANAT	Q16613	207 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RPE	Q96AT9	228 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059		A0A087X0M5	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GX30	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	ORC5	O43913	435 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	GADD45A	P24522	165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	MNDA	P41218	407 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	VEGFC	P49767	419 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	QRFP	P83859	136 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	MXD1	Q05195	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	MMP28	Q9H239	520 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CHID1-222	ENST00000533059	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.2	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms