RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524884.1

BBS1-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 4

Gene BBS1, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-206	ENST00000524884	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		Q9H8V8	135 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		U3KQA8	63 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	APC2	O95996	2303 aa		4.27	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		A8MUA0	341 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		D6RAR5	112 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		E5RGE8	158 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		G3V3Q6	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	SULT2B1	O00204	365 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	XRCC2	O43543	280 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CBR3	O75828	277 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	IFNA21	P01568	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	NMB	P08949	121 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	FOLR1	P15328	257 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	DTYMK	P23919	212 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	S100G	P29377	79 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	SRD5A2	P31213	254 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	BMI1	P35226	326 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	GLP1R	P43220	463 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR3A2	P47893	321 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	DSCR9	P59020	149 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884		Q5BKY6	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	RND1	Q92730	232 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.26	□□□□□ -1.73
BBS1-206	ENST00000524884	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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