RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5G3P48201 142 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALDH3B2P48448 385 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP1B3P54709 279 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKNOX1P55347 436 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCN6P62502 163 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPM4P67936 248 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CX3CL1P78423 397 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDPQ00604 133 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFA5Q01523 94 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLA2G7Q13093 441 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R7Q15435 360 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1Q1Q15612 314 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 UGT3A2Q3SY77 523 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TDRG1Q3Y452 100 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC36A3Q495N2 470 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNC50Q53HI1 259 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf141Q5SZD1 244 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 OTPQ5XKR4 325 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLCXD3Q63HM9 321 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LEMD1Q68G75 181 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CORO6Q6QEF8 472 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT74Q7RTS7 529 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF573Q86YE8 665 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM223AQ8IWN6 122 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENTHD1Q8IYW4 607 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 BATF2Q8N1L9 274 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS35Q8N3Z0 413 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MFSD4AQ8N468 514 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00471Q8N535 108 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNG3Q8TAE7 436 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPEARQ8WU66 669 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 AQP3Q92482 292 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCGR1BQ92637 280 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNA7Q96RP8 456 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35A5Q9BS91 424 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MID1IP1Q9NPA3 183 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MED4Q9NPJ6 270 aa1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR173Q9NS66 373 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRHPRQ9UBQ7 328 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 AASSQ9UDR5 926 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSG11Q9UQ72 335 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.26□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TLDC2A0PJX2 215 aa1.26□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LRCOL1A6NCL2 159 aa1.26□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 J3QT63 122 aa1.26□□□□□ -2.21
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CHP2O43745 196 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 AHCYL1O43865 530 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PROP1O75360 226 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PITX3O75364 302 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF737O75373 536 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SULT1C4O75897 302 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIAS1O75925 651 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR7A10O76100 309 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT75O95678 551 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYB5AP00167 134 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CA2P00918 260 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1D-12P01611 117 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV3-1P01715 115 aa1.26□□□□□ -2.21
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