RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512677.1

PIK3R4-208, Transcript of phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PIK3R4, Length 744 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3R4-208	ENST00000512677	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A087WXM4	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A0U1RQK1	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		F8VVB4	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		F8VWA3	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		M0QZK8	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	AIP	O00170	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC17A2	O00624	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PDCD6	O75340	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CDRT1	O95170	752 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IL1A	P01583	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SELL	P14151	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GADD45A	P24522	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CDK2	P24941	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PSMB9	P28065	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	DUSP1	P28562	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAB7A	P51149	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SCAND1	P57086	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF273	Q14593	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAB11B	Q15907	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PNKD	Q8N490	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PTX4	Q96A99	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SSX3	Q99909	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		A0A1W2PPK0	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	F2RL2	O00254	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TIMM23	O14925	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC22A1	O15245	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MPIG6B	O95866	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CD37	P11049	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CCL3L1	P16619	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAB3B	P20337	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	COX7A1	P24310	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CFP	P27918	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GLIPR1	P48060	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAG2	P55895	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	DLX6	P56179	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	P2RY14	Q15391	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TAF9	Q16594	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	RPE	Q96AT9	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	GALM	Q96C23	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677		Q96M66	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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