RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 HMGCS1Q01581 520 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 RAB31Q13636 194 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FZD2Q14332 565 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 GINS1Q14691 196 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAM27D1Q5T7N8 215 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAM71E1Q6IPT2 247 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 REG3GQ6UW15 175 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 TOMM20LQ6UXN7 152 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 DHFR2Q86XF0 187 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF440Q8IYI8 595 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CLDN22Q8N7P3 220 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 OR4K17Q8NGC6 315 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 NEIL3Q8TAT5 605 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAM3DQ96BQ1 224 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINI1Q99574 410 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 UGT2B28Q9BY64 529 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 DSN1Q9H410 356 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 PTGES2Q9H7Z7 377 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ISYNA1Q9NPH2 558 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 BIN3Q9NQY0 253 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 INIPQ9NRY2 104 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 DUX4Q9UBX2 424 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 GLS2Q9UI32 602 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF391Q9UJN7 358 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 SIGLEC9Q9Y336 463 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 KLF12Q9Y4X4 402 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 HSPB11Q9Y547 144 aa1.66□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CLUHO75153 1309 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FTCDNL1E5RQL4 147 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 LINC01619G3V211 115 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 PHYHO14832 338 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CCNKO75909 580 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 IFNA21P01568 189 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CST2P09228 141 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FBP1P09467 338 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF806P0C7X5 589 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CHTF8P0CG12 524 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF286BP0CG31 522 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 PGA5P0DJD9 388 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 SLC2A1P11166 492 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ADRB3P13945 408 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 MYL12AP19105 171 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 IL2RGP31785 369 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 MYCNOSP40205 109 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 EIF1P41567 113 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 TTPAP49638 278 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CAV2P51636 162 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1CBP62140 327 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ESRRGP62508 458 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAM3AP98173 230 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CD164Q04900 197 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 AESQ08117 197 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CD300CQ08708 224 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 SLC9A3R2Q15599 337 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 NSDHLQ15738 373 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS8Q16651 343 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 GSG1Q2KHT4 349 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CDNFQ49AH0 187 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 MED27Q6P2C8 311 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZT83 130 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 DPPA2Q7Z7J5 298 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 NPBQ8NG41 125 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 OR1M1Q8NGA1 313 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 OR10G4Q8NGN3 311 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 OR5AR1Q8NGP9 310 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 OR10G6Q8NH81 332 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 OR51E1Q8TCB6 317 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 RNF138Q8WVD3 245 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ARPC1AQ92747 370 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 RNF185Q96GF1 192 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 MBOAT7Q96N66 472 aa1.65□□□□□ -2.14
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM96AQ9H5X1 160 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 ABCB9Q9NP78 766 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 FAIMQ9NVQ4 179 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 KLK13Q9UKR3 277 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFAF1Q9Y375 327 aa1.65□□□□□ -2.14
PDE4D-218ENST00000509368 CEP250Q9BV73 2442 aa1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FRYLO94915 3013 aa1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PCNX3Q9H6A9 2034 aa1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TPRP12270 2363 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM166BA8MTA8 275 aa1.65□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FABP7O15540 132 aa1.65□□□□□ -2.15
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