RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF626Q68DY1 528 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6YL49 198 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TCF23Q7RTU1 214 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5R1Q8NH85 324 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MRGPRDQ8TDS7 321 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL11Q969Q4 196 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB3CQ96E17 227 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2QL1A1L167 161 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS11O94810 467 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CGB3P0DN86 165 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CGB7P0DN87 165 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 COX7A1P24310 79 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 HTR1DP28221 377 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SAA4P35542 130 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PITPNAQ00169 270 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 IDNKQ5T6J7 187 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PDZD9Q8IXQ8 264 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BEND2Q8NDZ0 799 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR9G1Q8NH87 305 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 JMJD1CQ15652 2540 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NF1P21359 2839 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LEUTXA8MZ59 168 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OOSP1A8MZH6 123 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LPLP06858 475 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CD3GP09693 182 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH3B2P48448 385 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 KLRD1Q13241 179 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BRICD5Q6PL45 260 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 AP3S1Q92572 193 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 GALMQ96C23 342 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DIABLOQ9NR28 239 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 DPM3Q9P2X0 92 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA2Q9UM82 520 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0U1RQK1 487 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SOCS1O15524 211 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 GABARAPO95166 117 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TFAP2AP05549 437 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CRYBA1P05813 215 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NFYBP25208 207 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 IL3RAP26951 378 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TALDO1P37837 337 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINB10P48595 397 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RORCP51449 518 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 HTD2P86397 168 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 STEAP3Q658P3 488 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 HCP5Q6MZN7 132 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4K15Q8NH41 348 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NDNFQ8TB73 568 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC107Q8WV48 283 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 KIRREL1Q96J84 757 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 CMTM3Q96MX0 182 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 NICN1Q9BSH3 213 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB18Q9NP72 206 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 ODF3BA8MYP8 253 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 F2RL2O00254 374 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 MELTFP08582 738 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 BRS3P32247 399 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SOX6P35712 828 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS19P39019 145 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 TMBIM6P55061 237 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP2-208ENST00000504294 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms