RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF488Q96MN9 340 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 FEVQ99581 238 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 RNF150Q9ULK6 438 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 GPR176Q14439 515 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF691Q5VV52 312 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PRR25Q96S07 402 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 DIRAS1O95057 198 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TFF1P04155 84 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 GYPBP06028 91 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 RFKQ969G6 155 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ADI1Q9BV57 179 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 JPT1Q9UK76 154 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 NUPR2A6NF83 97 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 DEGS1O15121 323 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1D-33P01593 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1-33P01594 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 FGF2P09038 288 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PRKACAP17612 351 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1B2P21281 511 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SOX6P35712 828 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 RAB9AP51151 201 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LCN12Q6JVE5 192 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 DHFR2Q86XF0 187 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PSG11Q9UQ72 335 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 F8VVB4 439 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 F8VWA3 439 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 YPEL1O60688 119 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 GABRR1P24046 479 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 EPHA2P29317 976 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 THRSPQ92748 146 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 YPEL2Q96QA6 119 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V0BQ99437 205 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 DHDHQ9UQ10 334 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SHISA3A0PJX4 238 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 CIB2O75838 187 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 OR2A4O95047 310 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 BAG2O95816 211 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV1D-12P01611 117 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 CD37P11049 281 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PITPNAQ00169 270 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LSAMPQ13449 338 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 OR11H1Q8NG94 326 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 PYDC1Q8WXC3 89 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SPACA5Q96QH8 159 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 MED20Q9H944 212 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 HERC2O95714 4834 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 COL7A1Q02388 2944 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 OR5H14A6NHG9 310 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS9O00182 355 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2CO00762 179 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SULT1B1O43704 296 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 SPNP16150 400 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-210ENST00000503258 MC5RP33032 325 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms