RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM90A13PP0C7W8 464 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM90A14PP0C7W9 464 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM90A24PP0C7X0 464 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 VSIG8P0DPA2 414 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 GZMHP20718 246 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 HTR2CP28335 458 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SSTR5P35346 364 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 DYNLT3P51808 116 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PRRX1P54821 245 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SSX1Q16384 188 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SIGIRRQ6IA17 410 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CYYR1Q96J86 154 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 GFI1Q99684 422 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNK15Q9H427 330 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 RAB18Q9NP72 206 aa13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 A6NDX4 124 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 LEUTXA8MZ59 168 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC22A1O15245 554 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3-7P01780 117 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 FUT3P21217 361 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 HLA-DRB5Q30154 266 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM219Q86XT9 240 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SPARTQ8N0X7 666 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SVOPQ8N4V2 548 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 OR9G1Q8NH87 305 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 ETAA1Q9NY74 926 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 TCF19Q9Y242 345 aa13.6□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 UBE2QL1A1L167 161 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 C15orf65H3BRN8 121 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 AIPO00170 330 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 F2RL2O00254 374 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PDCD6O75340 191 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PROK1P58294 105 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 UNC119Q13432 240 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 P2RY14Q15391 338 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 SGMS2Q8NHU3 365 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 UBALD1Q8TB05 177 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 ARL11Q969Q4 196 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 MMP28Q9H239 520 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 PSG11Q9UQ72 335 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC42Q9Y546 428 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13.59□□□□□ -0.23
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 LY6LH3BQJ8 138 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 H3BUI4 141 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 J3QR06 171 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC17A2O00624 439 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 BPNT1O95861 308 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 GLAP06280 429 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CEACAM3P40198 252 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP10-3P60369 221 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 QRFPP83859 136 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 GAPTQ8N292 157 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4K15Q8NH41 348 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CREB3L1Q96BA8 519 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.58□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 ORC5O43913 435 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CD24P25063 80 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 KIR2DS4P43632 304 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 GNG10P50151 68 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 RAB11BQ15907 218 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 TM2D1Q9BX74 207 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1W2PPE3 182 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 C12orf77C9JDV5 145 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CA11O75493 328 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 ARSBP15848 533 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 PSMB9P28065 219 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CHATP28329 748 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 BRS3P32247 399 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 C6orf183Q5T699 404 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-205ENST00000496887 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms