RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494333.1

RIF1-211, Transcript of replication timing regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RIF1, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1-211ENST00000494333 ODF3BA8MYP8 253 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MAGEB3O15480 346 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CHST1O43916 411 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RAB3AP20336 220 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 P2RX3P56373 397 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ZP1P60852 638 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 SLC34A1Q06495 639 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 IL18R1Q13478 541 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CCDC58Q4VC31 144 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ZNF691Q5VV52 312 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TTC23Q5W5X9 447 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 XAF1Q6GPH4 301 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 NDNFQ8TB73 568 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 GPR148Q8TDV2 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 GPER1Q99527 375 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MMP27Q9H306 513 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RHOFQ9HBH0 211 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.5□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 IRGMA1A4Y4 181 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 H0YJX3 145 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 KCNAB3O43448 404 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CD2P06729 351 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MYL12AP19105 171 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CDK2P24941 298 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HTR1DP28221 377 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 DEFA6Q01524 100 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CDK5R1Q15078 307 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OR52W1Q6IF63 320 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 Q6P435 159 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 Q6ZTK2 550 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TMEM219Q86XT9 240 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CHST4Q8NCG5 386 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CORO2AQ92828 525 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TMEM106AQ96A25 262 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TMEM80Q96HE8 168 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 TCF19Q9Y242 345 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ANK2Q01484 3957 aa6.49□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ODAMA1E959 279 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 FAM172BPA6NC97 362 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 A6NDX4 124 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 GABRPO00591 440 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HSPB6O14558 160 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 OGG1O15527 345 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 LALBAP00709 142 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 CSN2P05814 226 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 EFNB2P52799 333 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 MED21Q13503 144 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HERPUD1Q15011 391 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RCN1Q15293 331 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 RSU1Q15404 277 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ELP2Q6IA86 826 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 C11orf88Q6PI97 169 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.48□□□□□ -1.37
RIF1-211ENST00000494333 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms