RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 OR7G2Q8NG99 324 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8K3Q8NH51 312 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NUBPLQ8TB37 319 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 DOHHQ9BU89 302 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MED18Q9BUE0 208 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SCRT1Q9BWW7 348 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A8Q9BY19 250 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 BPESC1Q9GZL8 116 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF122Q9H9V4 155 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 HMG20AQ9NP66 347 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNRD1Q9P1U0 126 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF337Q9Y3M9 751 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MMACHCQ9Y4U1 282 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MYCBP2O75592 4640 aa1.84□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0J9YW62 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM223A0PJW6 202 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 BET1O15155 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ERI3O43414 337 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF21O43680 179 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC6AO75865 159 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SCELO95171 688 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 VAMP5O95183 116 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 VAPBO95292 243 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TPM2P07951 284 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TACSTD2P09758 323 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 USF1P22415 310 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 F2RP25116 425 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 AGTR1P30556 359 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL22P35268 128 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CEACAM3P40198 252 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PEX19P40855 299 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC1A2P43004 574 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 UBA52P62987 128 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MYL5Q02045 173 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CDH17Q12864 832 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RCAN2Q14206 197 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF726P1Q15940 193 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LY6EQ16553 131 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRNQ5BIV9 151 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE1CQ5T751 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL21CQ5VZV1 264 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 GALNT10Q86SR1 603 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR86Q86TI4 376 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 BBOF1Q8ND07 529 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MORN4Q8NDC4 146 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2M3Q8NG83 312 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SGMS2Q8NHU3 365 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ACMSDQ8TDX5 336 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 C22orf15Q8WYQ4 148 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 YIPF5Q969M3 257 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SNF8Q96H20 258 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF382Q96SR6 550 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 VAT1Q99536 393 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC77Q9BR77 488 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 KIFC1Q9BW19 673 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 EXO5Q9H790 373 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS37BQ9H9H4 285 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC1Q9HC57 220 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PITPNC1Q9UKF7 332 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CES1P1Q9UKY3 287 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB4Q9Y574 426 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0A6YYD5 115 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SMCO3A2RU48 225 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A20A6NK97 555 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 C9JVG2 144 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C417 338 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PLPP1O14494 284 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNDC9O14530 226 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM1O15116 133 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 FADS1O60427 444 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PIAS1O75925 651 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LYZL6O75951 148 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CATP04040 527 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINA6P08185 405 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35G6P0C7Q6 338 aa1.82□□□□□ -2.12
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