RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, human

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRT1-208	ENST00000486917	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	PRR25	Q96S07	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	AASS	Q9UDR5	926 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	ELANE	P08246	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	GABRB1	P18505	474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	GZMH	P20718	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	FHL3	Q13643	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	RSU1	Q15404	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	GPER1	Q99527	375 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	MAGEB3	O15480	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	HTR3B	O95264	441 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	CD1B	P29016	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	S1PR3	Q99500	378 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRRT1-208	ENST00000486917	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	EI24	O14681	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	CDRT1	O95170	752 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	MOS	P00540	346 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	IGHG4	P01861	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ECI1	P42126	302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ORC5	O43913	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	PSMB8	P28062	276 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	SOX2	P48431	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	RASSF2	P50749	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF137P	P52743	207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917		Q3ZCU0	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ASCL2	Q99929	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC31A2	O15432	143 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	TXNL1	O43396	289 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	MT-ND4	P03905	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	IGF1	P05019	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	VDAC1	P21796	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	IL3RA	P26951	378 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	CHAT	P28329	748 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	SOX6	P35712	828 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	VHL	P40337	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	F2RL1	P55085	397 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	RAB40B	Q12829	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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