RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484483.1

PTP4A2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 2

Gene PTP4A2, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	HSPB6	O14558	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC22A1	O15245	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	VENTX	O95231	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	CSN2	P05814	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	UBB	P0CG47	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	HTR2C	P28335	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	GLIPR1	P48060	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	KCNJ3	P48549	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	UBE2E1	P51965	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	DLX6	P56179	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	P2RX3	P56373	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	HILS1	P60008	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	AES	Q08117	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	GFI1	Q99684	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483		V9GY05	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-205	ENST00000484483	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483		A0A0U1RQK1	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC17A2	O00624	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	PDCD5	O14737	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	NPFF	O15130	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MMP23A	O75900	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RBP4	P02753	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MT-ND4	P03905	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	GLA	P06280	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CGB3	P0DN86	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CGB7	P0DN87	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MGMT	P16455	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CD36	P16671	472 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	GZMH	P20718	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FUT3	P21217	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	COX7A1	P24310	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MYL9	P24844	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RANBP1	P43487	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	QRFP	P83859	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	NHLH2	Q02577	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	BAMBI	Q13145	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	KLRD1	Q13241	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	P2RY14	Q15391	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	NEDD8	Q15843	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB11B	Q15907	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MIDN	Q504T8	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms