RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 FAM27D1Q5T7N8 215 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM91Q6ZNR0 172 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR4P4Q8NGL7 312 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PEX16Q9Y5Y5 336 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PP11 408 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 AIPO00170 330 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SLC17A2O00624 439 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SPINT2O43291 252 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PDCD6O75340 191 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MMP23AO75900 390 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MT-ND4P03905 459 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ARSBP15848 533 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MDKP21741 143 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OMGP23515 440 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NFYBP25208 207 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CALRP27797 417 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 FABP5Q01469 135 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DRB5Q30154 266 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SPARTQ8N0X7 666 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 GAPTQ8N292 157 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM104Q8NE00 496 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR4C13Q8NGP0 309 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C17orf50Q8WW18 174 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TM2D1Q9BX74 207 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MMP28Q9H239 520 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 BANF2Q9H503 90 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ETAA1Q9NY74 926 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TCF19Q9Y242 345 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RNF114Q9Y508 228 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 V9GY05 133 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 J3QR06 171 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 F2RL2O00254 374 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MPIG6BO95866 241 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 VSIG8P0DPA2 414 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MYL9P24844 172 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 KIR2DS4P43632 304 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RELBQ01201 579 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 LINC01006Q8NI28 216 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PIFOQ8TCI5 191 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ARL11Q969Q4 196 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 HILPDAQ9Y5L2 63 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 LPLP06858 475 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 RAB7AP51149 207 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 MADCAM1Q13477 382 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 RAB11BQ15907 218 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 STEAP3Q658P3 488 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 ZNF773Q6PK81 442 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZSV7 163 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 FAM46BQ96A09 425 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 C15orf65H3BRN8 121 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 IL3RAP26951 378 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 PSMB9P28065 219 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 SSTR5P35346 364 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 SSX1Q16384 188 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 LY6EQ16553 131 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 OR10X1Q8NGY0 326 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 RPEQ96AT9 228 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 HSF4Q9ULV5 492 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 PSG11Q9UQ72 335 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-211ENST00000476336 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms