RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 BLVRAP53004 296 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2BQ00403 316 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SKP2Q13309 424 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS21Q2M5E4 152 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR9Q5T870 116 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TAMM41Q96BW9 452 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO5BQ9ULV0 1848 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 COL1A2P08123 1366 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 A8MUU9 505 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 F5H5T6 163 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ISLRO14498 428 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC16A4O15374 487 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IFNGR2P38484 337 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MP68P56378 58 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ELP2Q6IA86 826 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IL37Q9NZH6 218 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC11Q96J66 1382 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZW10O43264 779 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ADORA1P30542 326 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MPV17P39210 176 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPA13P48723 471 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 FUT5Q11128 374 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TTMPQ5BVD1 217 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N402 240 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 OR8S1Q8NH09 359 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF721Q8TF20 911 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB13Q8WXK3 278 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PEBP4Q96S96 227 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf50Q9BV19 199 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM206AQ9NX38 181 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 C21orf140B9A014 251 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CXCR6O00574 342 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1-17P01599 117 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SERPINA6P08185 405 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CD99P14209 185 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CD79BP40259 229 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 INPP1P49441 399 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT2P50583 147 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF83P51522 516 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB2AP61019 212 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MAL2Q969L2 176 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 VSIRQ9H7M9 311 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 C16orf90A8MZG2 172 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRN3E7EW58 273 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS5O15539 181 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 TYMSP04818 313 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 AGTR1P30556 359 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 IMPG1Q17R60 797 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 CENPWQ5EE01 88 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 HES3Q5TGS1 186 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 PTH2Q96A98 100 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 M0QYV0 167 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 PFDN6O15212 129 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 SSNA1O43805 119 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 STX10O60499 249 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 APOEP02649 317 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 CD5P06127 495 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 MIPP30301 263 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-205ENST00000462042 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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