RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 GLYATL3Q5SZD4 288 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OTPQ5XKR4 325 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52W1Q6IF63 320 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 HIST2H3AQ71DI3 136 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 GDPD3Q7L5L3 318 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NFE4Q86UQ8 179 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NAA40Q86UY6 237 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NR2C2APQ86WQ0 139 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 FTMTQ8N4E7 242 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 CD177Q8N6Q3 437 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 UBALD1Q8TB05 177 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TOMM40LQ969M1 308 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RPEQ96AT9 228 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TESCQ96BS2 214 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF799Q96GE5 643 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MCHR1Q99705 422 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NRIP2Q9BQI9 281 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A19Q9HC21 320 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 BTNL2Q9UIR0 455 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SIGLEC7Q9Y286 467 aa2.95□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A087X0K7 114 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 hADV38S2A0JD32 116 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PRORSD1PA6NEY8 169 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PRAC2D3DTV9 90 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 E9PBE3 544 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 H7C1C5 153 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 K7N7A8 449 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 XKRYO14609 159 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TOR1AO14656 332 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V0E1O15342 81 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 XRCC2O43543 280 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TPST1O60507 370 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TPST2O60704 377 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OR7A10O76100 309 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TSHBP01222 138 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNA10P01566 189 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNA14P01570 189 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1D-33P01593 117 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1-33P01594 117 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MT-ND1P03886 318 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ALPLP05186 524 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV2-30P06310 120 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPAN19P0C672 248 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 NCK1P16333 377 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 CTRB1P17538 263 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ANOS1P23352 680 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 AQP1P29972 269 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PRDX2P32119 198 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX6P35712 828 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 PRRX1P54821 245 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 APOC4P55056 127 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJB13P59910 316 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 LCN6P62502 163 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC74AQ0VAA2 488 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB40BQ12829 278 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 APOFQ13790 326 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TAF13Q15543 124 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SNCBQ16143 134 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-DRB5Q30154 266 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RFX4Q33E94 735 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SNAI3Q3KNW1 292 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SPANXN4Q5MJ08 99 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 CTRB2Q6GPI1 263 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OR6V1Q8N148 313 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SPTSSAQ969W0 71 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 TSSK2Q96PF2 358 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF426Q9BUY5 554 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RERGLQ9H628 205 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 SP140LQ9H930 580 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCB9Q9NP78 766 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 RASL12Q9NYN1 266 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 MDFICQ9P1T7 246 aa2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ECHDC1-211ENST00000460558 LHFPL6Q9Y693 200 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms