RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 NUP37Q8NFH4 326 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DIO2Q92813 273 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ORM1P02763 201 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 STC1P52823 247 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CDK5R1Q15078 307 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM99Q8N816 258 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GPR146Q96CH1 333 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 PBRM1Q86U86 1689 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0U1RQF3 1178 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 CHST1O43916 411 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LMO3Q8TAP4 145 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 SCN9AQ15858 1988 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf94C9JXX5 98 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IL18BPO95998 194 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NPPBP16860 134 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CD33P20138 364 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 Q7L0L9 218 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN19Q8N6F1 224 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OXGR1Q96P68 337 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 F8VWA3 439 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 KBTBD11O94819 623 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 P04436 131 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 CSN3P07498 182 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-209ENST00000442510 R4GN57 208 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 KDM6BO15054 1643 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087X0K7 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SERINC4A6NH21 518 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 COX6CP09669 75 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.89□□□□□ -1.63
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