RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 SGCEO43556 437 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 TNFAIP8O95379 198 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 ACTL6AO96019 429 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 MAXP61244 160 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 PNOCQ13519 176 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 CRLF3Q8IUI8 442 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 LCN9Q8WX39 176 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 NRTNQ99748 197 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 C20orf144Q9BQM9 153 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF251Q9BRH9 671 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SRRQ9GZT4 340 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF442Q9H7R0 627 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 WIF1Q9Y5W5 379 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 F8VZ95 297 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 HAT1O14929 419 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 CD5LO43866 347 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 P01737 135 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 KDELR2P33947 212 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 TALDO1P37837 337 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 MAGEA3P43357 314 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 UBE2AP49459 152 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 OR12D2P58182 307 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 MTPNP58546 118 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 TPBGQ13641 420 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 GUSBP1Q15486 140 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 JOSD2Q8TAC2 188 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 ABHD3Q8WU67 409 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 LYSMD1Q96S90 227 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 VAT1Q99536 393 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 PSMD13Q9UNM6 376 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 MTORP42345 2549 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 WDR59Q6PJI9 974 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 OR11G2Q8NGC1 345 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 Q96MT0 163 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 IFT46Q9NQC8 304 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SPG11Q96JI7 2443 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-212ENST00000434424 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM213A2RRL7 107 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SULT1C2O00338 296 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 IGLV1-47P01700 117 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 RD3LP0DJH9 198 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 SSTR5P35346 364 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF136P52737 540 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 FLOT2Q14254 428 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRK-212ENST00000434424 AVPI1Q5T686 147 aa4.97□□□□□ -1.61
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