RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN13Q12923 2485 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WZY1 265 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GW55 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FCGR2AP12318 317 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP1P28562 367 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZXDAP98168 799 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6P435 159 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LGI3Q8N145 548 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NAT6Q93015 286 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM106CQ9BVX2 250 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TREM1Q9NP99 234 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4Q9UBX2 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXNB1O43157 2135 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF728P0DKX0 622 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CGB3P0DN86 165 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CGB7P0DN87 165 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GZMBP10144 247 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCL1P50553 236 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGN3Q15651 99 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM189A2Q15884 450 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TRDCB7Z8K6 153 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SCTP09683 121 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PET100P0DJ07 73 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP9P14780 707 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA2P20848 420 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGA3P26006 1051 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MLF1P58340 268 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDX4Q13162 271 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GAMTQ14353 236 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LUZP4Q9P127 313 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SGCEO43556 437 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALT1P15291 398 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN18P56856 261 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DIRC2Q96SL1 478 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NEU1Q99519 415 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CRLF2Q9HC73 371 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR173Q9NS66 373 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 YKT6O15498 198 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NEURL1O76050 574 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 AMBPP02760 352 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LBX1P52954 281 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BAXQ07812 192 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GUSBP11Q6P575 273 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 M1APQ8TC57 530 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RGCCQ9H4X1 137 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV20A0A0B4J274 112 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNL4K9M1U5 179 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN15O95858 294 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB5BP61020 215 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4X1Q8NH49 305 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX1O43812 170 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFAND5O76080 213 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL2P10415 239 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ESDP10768 282 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF20P17024 532 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RBP2P50120 134 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GUSBP1Q15486 140 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL6Q6ICC9 239 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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