RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 NAA40Q86UY6 237 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 STPG4Q8N801 248 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR51A7Q8NH64 312 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM239Q8WW34 195 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 STMN2Q93045 179 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CXorf58Q96LI9 332 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 GAFA1Q96PS6 74 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RAB40CQ96S21 281 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 MED31Q9Y3C7 131 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 KMT2AQ03164 3969 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 HERC2O95714 4834 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 PRSS37A4D1T9 235 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RNF222A6NCQ9 220 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 M0QX08 132 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SDHDO14521 159 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CDIPTO14735 213 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SIGLEC5O15389 551 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 AKR7A2O43488 359 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 IFNA6P05013 189 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 PRSS1P07477 247 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 IDO1P14902 403 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CCL3L1P16619 93 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 GPR183P32249 361 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR3A4PP47883 348 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SLC7A2P52569 658 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SLC25A1P53007 311 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CAV3P56539 151 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF92Q03936 586 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CYP51A1Q16850 503 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 WDR82Q6UXN9 313 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 IFT20Q8IY31 132 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OSR2Q8N2R0 312 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR2T27Q8NH04 317 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 LZICQ8WZA0 190 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 GTF2H4Q92759 462 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 MALSU1Q96EH3 234 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 Q96M85 177 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 P2RX4Q99571 388 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ATF6BQ99941 703 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SYT4Q9H2B2 425 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 YY1AP1Q9H869 796 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 OR2AT4A6NND4 320 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 H3BSH0 61 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 LYNP07948 512 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 HCKP08631 526 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SLC2A1P11166 492 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ANOS1P23352 680 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SLC6A1P30531 599 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 POU3F4P49335 361 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 VEGFCP49767 419 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CRYBA2P53672 197 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK-16P61578 105 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 SLC35B1P78383 322 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 STX3Q13277 289 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 RFX4Q33E94 735 aa3.5□□□□□ -1.85
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