RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
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ODC1-202ENST00000405333 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.72■□□□□ 0.27
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ODC1-202ENST00000405333 PTPN13Q12923 2485 aa16.72■□□□□ 0.27
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ODC1-202ENST00000405333 PPYP01298 95 aa16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 IGKV1-13P0DP09 117 aa16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 FAM234AQ9H0X4 552 aa16.7■□□□□ 0.26
ODC1-202ENST00000405333 KCNIP1Q9NZI2 227 aa16.7■□□□□ 0.26
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